生命组学

课程编码：2802160710Z1M2001 英文名称：Life-omics 课时：60 学分：3.00 课程属性：专业核心课 主讲教师：刘石平等

教学内容包括：以基因组学、表观组学、RNA组学、蛋白质组学、代谢组学等为代表的生命科学前沿发展日新月异，生命组学将介绍这些领域的基本概念、常用技术与发展方向。“组学”的基本属性是高通量获取数据、构建并行化技术平台和完善规模化、系统化的科学研究体系。生命组学基本研究内容包括如下几个领域：（1）生物医学（生理解剖板块）；（2）分子与细胞生物学（分子细胞板块）；（3）遗传与群体遗传学（基因型表型板块）；（4）多流系统生物学（现象机制板块）。
教学目的包括：（1）在“五流通悟”（信息流、操作流、平衡流、分室流和可溯流）的思维框架下，介绍生命组学各领域的基本概念、基本方法和基本科学问题。（2）深入介绍生命组学核心领域的主要技术和原理；（3）回顾生命组学各领域的发展，总结近五年来的进展，展望未来的可能应用和发展前景。

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第一章 前言：从“人类基因组计划”到全民基因组测序工程
第1节 《人类基因组计划》与全民基因组测序的应用 1学时 刘龙奇
第2节 数字基因、数字医疗与数字健康 2学时 刘龙奇
第3节 “三数工程”、元宇宙、健康中国2030 1学时 刘龙奇
第二章 基因组学技术
第1节 DNA测序技术 4学时 刘石平
第2节 数据库与生物信息技术 10学时 刘石平
第三章 谱系基因组学入门
第1节 宏/泛基因组 8学时 刘石平
第2节 脊椎动物和人类基因组研究 4学时 刘石平
第四章 生命组学入门
第1节 生命科学新范式与组学概论 4学时 刘石平
第2节 表观遗传学的基本概念与技术 2学时 刘石平
第3节 精准医学相关数据库 4学时 刘石平
第4节 RNA组学的基本概念与单细胞转录组技术 2学时 刘石平
第五章 蛋白质组学概论
第1节 蛋白质组学概论 6学时 刘石平
第六章 代谢组学与其他组学应用
第1节 代谢组学与其他组学应用 4学时 刘石平
第七章 课堂讨论
第1节 首席教授课堂讨论 2学时 刘石平
第2节 主讲教师1课堂讨论 2学时 刘石平
第3节 主讲教师2课堂讨论 2学时 刘石平
第八章 考试
第1节 考试 2学时 刘石平

刘龙奇，博士，研究员, 2015年博士毕业于中国科学院并加入华大，现任华大生命科学研究院超级细胞所所长，单细胞组学首席科学家,杭州华大生命科学研究院执行院长，中国科学院大学博士研究生导师。同时担任南方科技大学业界导师、南开大学硕士研究生校外指导教师、西北大学兼职教授、郑州大学硕士研究生导师。Human Cell Atlas (人类细胞图谱)亚洲联盟成员，粤港澳大湾区单细胞组学联盟主要发起人之一，时空组学全球联盟发起人之一。
刘石平，现任深圳华大生命科学研究院超级细胞研究所主任科学家，数字化中心负责人，研究员，华南理工大学博士，2009年加入华大研究院，主要从事单细胞基因组学、群体遗传学、比较基因组学等生物信息研究，研究方向包括：生物信息学、单细胞多组学、脑科学等前沿领域。已发表SCI等收录论文21篇。