课程大纲

课程大纲

功能基因组学

课程编码:480121090100P1008 英文名称:Functional Genomics 课时:40 学分:2.00 课程属性:学科核心课 主讲教师:王冰等

教学目的要求
本课程主要以模式植物在功能基因组研究中所采用的主要研究手段以及取得的重要研究成果为主要教授内容。要求通过对该课程的学习,使学生能较够全面和深入理解功能基因组学原理和应用,并掌握生命科学研究的设计思路和基因组及其功能研究策略,以求为以后的学习和科研工作打下良好和扎实的理论基础。

预修课程
生物化学、分子生物学

大纲内容
第一章 总论
第1节 功能基因组学绪论 3.0学时
第二章 单细胞功能基因组学
第1节 遗传信息可视化方法 3.0学时
第2节 动物关键功能基因的大规模筛选 3.0学时
第3节 动物关键性状的全基因组关联分析 3.0学时
第三章 植物塑形的功能基因组学
第1节 植物形态特征及构造基础 3.0学时
第2节 植物细胞壁与植物塑形 3.0学时
第3节 维管组织建成与植物塑形 3.0学时
第4节 植物塑形研究前沿主题研讨 3.0学时
第5节 植物塑形研究前沿进展与展望 3.0学时
第四章 植物配子形成的功能基因组学
第1节 基因组学技术发展 3.0学时
第2节 单细胞组学技术发展 3.0学时
第3节 空间组学技术发展 3.0学时
第4节 考前辅导及考试 4.0学时

参考书
1、 功能基因组学 徐子勤 2007年6月 科学出版社

课程教师信息
1. 王冰,博士,研究员,博士生导师
2011年获中国科学院大学博士学位。国家自然科学基金委“优青”获得者(2021)、“青A”获得者(2025)、中国科学院青年创新促进会会员(2019)、优秀会员(2023)。长期从事独脚金内酯等植物激素调控作物株型和耐逆抗病性研究,以第一或通讯作者在Cell、Nature、Mol Plant、Plant Cell、PNAS、Annu Rev Plant Biol等国际期刊发表论文20余篇,撰写植物激素学术专著《Hormone Metabolism and Signaling in Plants》中“Strigolactones”章节。获全球植物科学新星奖(2025)、全国创新争先奖奖牌(2023)、第二届优秀女青年奖(2021)以及NSR Outstanding Editorial Group Member (2024),担任JIPB 编委、The Innovation 青年编委、The Innovation Life编委、NSR学科编辑组成员以及中国遗传学会农业蛋白质组分会委员。主持国家重点研发计划课题、中国科学院战略性先导科技专项(B类)课题、中国科学院战略性先导科技专项(A类)子课题、国家自然科学基金委面上项目等项目。
研究方向:重点研究新型植物激素独脚金内酯的合成及作用机理,在独脚金内酯调控作物株型和环境适应性领域取得系列原创性成果,为“减肥增产”和“抗病增产”的分子设计育种提供了新靶点和新方案。

2. 王延鹏,博士,研究员,博士生导师
2016年获中国科学院大学博士学位,论文入选中国科学院优秀博士论文。2016-2019年先后在美国马萨诸塞大学医学院和加州大学戴维斯分校从事博士后研究;2019-2022任遗传与发育生物学研究所青年研究员;2023年起任遗传与发育生物学研究所研究员,课题组组长。获“国家优秀青年基金”资助,入选中国科学院青促会会员,连续五年入选科睿唯安高被引科学家。
研究方向为:通过多学科交叉,开发新型基因组编辑、合成生物学等前沿生物技术,并开展作物性状的精准设计与改良;探索植物新型细胞递送、植物微生物组编辑等新技术和新策略,推进农业的可持续发展。

3. 艾有为,博士,研究员,博士生导师
2012与2016年获东北林大学士与博士学位。2010-2014年在哈兽研学习病毒学;2014-2021年在北生所进行博士/博后训练,师从王晓东院士研究细胞死亡机制与药物开发。2018年获博新计划支持。2021年加入中国科学院遗传发育所,任研究员、博士生导师。2024年获基金委“优秀青年科学基金项目”支持。
研究方向:综合生物、化学、医学等多学科知识,通过全基因组CRISPR-Cas9筛选、小分子化合物筛选、多组学分析等手段解析细胞死亡、损伤修复的机制,并进行药物开发。