纳米孔测序技术专业研讨
课程编码:180085071011P4002H
英文名称:Advances in Nanopore Sequencing
课时:20
学分:1.00
课程属性:研讨课
主讲教师:黄亿华等
教学目的要求
本课程将对目前已有的各种核酸和蛋白质测序技术进行系统介绍,并重点研讨新一代纳米孔测序技术的研发及应用。通过对最新的代表性文献的研讨分析纳米孔技术的核心问题、前沿进展、未来发展方向以及商业潜力,开拓学生视野并增强其对生物器械研发的关注度。在授课和研讨过程中都要求学生积极参与互动和讨论。本课程涉及生物学、化学、电子科学、生物信息等多个学科领域,鼓励不同学科背景的学生选修。
预修课程
生物化学、分子生物学
大纲内容
第一章 基因测序技术介绍 3学时 黄亿华
第1节 基因测序技术介绍
第二章 纳米孔基因测序技术
第1节 纳米孔的筛选与发现 3学时 黄亿华
第2节 控速方式与建库 3学时 娄继忠
第3节 DNA测序 3学时 娄继忠
第4节 RNA测序 3学时 娄继忠
第5节 甲基化检测 2学时 娄继忠
第三章 蛋白质测序技术 3学时 黄亿华
第1节 纳米孔蛋白质测序
教材信息
1、
Nanopore sequencing - an introduction
Daniel Branton and David Deamer
2019年
World Scientific publishing
参考书
1、
Nanopore sequencing - methods and protocols
Kazuharu Arakawa
2023年
Humana Press
课程教师信息
黄亿华, 国家杰出青年基金获得者、国家万人计划科技创新领军人才、中国科学院生物物理研究所研究员、中国科学院大学(国科大)“A”类岗位教授,科技部国家重点研发计划纳米孔测序重点专项的首席科学家,膜蛋白结构生物学专家。黄亿华课题组在革兰氏阴性细菌外膜生成领域取得了一系列突破性成果。2014 年解析了细菌外膜中的一种“淀粉样纤维”分泌通道CsgG 九聚体高分辨率晶体结构,催生了世界上首款生物纳米孔测序仪。
娄继忠,中国科学院生物物理研究所二级研究员,是科技部国家重点研发计划“变革性技术”关键科学问题纳米孔测序重点专项的首席科学家。在单分子设备研制及检测方面取得一些重要成果。