生物多样性统计分析
课程编码：180083070905P5004H
英文名称：Statistics Analysis of Biodiversity
课时：40
学分：1.00
课程属性：实验课
主讲教师：苏强
教学目的要求
本课程的主要目的与要求是，让学生充分了解物种多样性研究的主要科学问题，掌握其几种典型分布模式及主要影响因素，明确物种多样性研究的分析方法及实际应用，认识几种经典的理论模型，并结合多组全球性的实际观测数据，运用R语言开源性数据统计分析软件，最终使学生可以对群落物种多样性的调查数据和资料，独立进行分析、计算与研究。
预修课程
无
大纲内容
第一章 物种多样性研究的关键性科学问题 6.0学时 苏强
第1节 什么决定了物种多样性？
第2节 该问题的学术价值和现实意义
第3节 相关理论学说的概况
第4节 物种多样性决定机制完整理论解释的缺失与争议
第二章 物种多样性的典型分布模式 6.0学时 苏强
第1节 物种多样性纬度梯度分布格局
第2节 物种多样性海拔梯度分布格局
第3节 物种多样性与生产力的单峰分布关系
第三章 物种多样性研究的分析方法 6.0学时 苏强
第1节 指数类分析方法的计算与应用
第2节 几种模型类分析方法的假设条件与计算公式
第四章 分析方法理论研究的最新进展 6.0学时 苏强
第1节 物种多样性的分形理论模型
第2节 基于分形模型提出的“熵假说”
第3节 物种多样性的一般性分布规律
第4节 物种多样性的理论最大值1:1/2:1/3…
第五章 物种多样性研究数据的获取与使用 4.0学时 苏强
第1节 物种多样性研究数据的获取途径
第2节 研究数据的主要类型和常用格式
第3节 物种多样性研究数据与其他参数的匹配方式
第六章 R语言分析软件的简介与基本操作 4.0学时 苏强
第1节 R语言分析软件的下载和安装
第2节 数据类型、运算符号与控制语句
第3节 数据导入和数据可视化
第4节 常用程序包
第七章 R语言中分析物种多样性的主要程序 4.0学时 苏强
第1节 R语言中的vegan程序包
第2节 描述性统计
第3节 假设检验
第4节 线性回归分析
第5节 群落物种多样性分形模型的相关研究
第八章 物种多样性统计分析方法的实践 4.0学时 苏强
第1节 群落物种多样性研究数据实际演练与操作
教材信息
1、
高级R语言编程指南
哈德利·威克汉姆
2020年8月
机械工业出版社
参考书
1、
Biological Diversity: Frontiers in Measurement and Assessment
Anne E. Magurran, Brian J. McGill
2011年1月
Oxford University Press
2、
Pattern and Process in Macroecology
Kevin Gaston, Tim Blackburn
2000年11月
Blackwell Science
3、
The Unified Neutral Theory of Biodiversity and Biogeography
Stephen P. Hubbell
2001年5月
Princeton University Press
4、
R数据科学
哈德利·威克姆哈德利,加勒特·格罗勒
2018年8月
人民邮电出版社
5、
R绘图系统
保罗·莫雷尔
2020年12月
人民邮电出版社
课程教师信息
苏强，博士，副教授，中国科学院大学。研究方向以海水酸化为主要议题，从浮游生物营养动力学、浮游生物生物多样以及地理分化等方面，探讨温室气体对海洋生态系统的影响作用。