微生物组学前沿进展

课程编码：180085071005P4002H 英文名称：Progress in Microbiome 课时：20 学分：1.00 课程属性：研讨课 主讲教师：叶健等

微生物无处不在，驱动了人体和自然生态系统的物质、能量、信息流。微生物组学既是世界科技前沿，也事关国民经济主战场（工农业生产）、国家重大需求（生态环境保护修复）和人民生命健康（医药卫生）。本课程将从微生物组的知识缺口、研究方法、调控机制等多个层面探讨功能微生物组的进展。该课程将增强研究生对微生物组功能的全面认识。1）传授现代微生物组学的基本理论和研究方法； 2）系统梳理相关知识，提高学生理论与实践能力；3）要求选课学生具备一定的微生物学理论和实验基础。

微生物学、分子生物学

第一章 微生物组学基础 2学时 高程
第1节 微生物组学研究历史
第2节 微生物组学理论发展历史
第二章 肠道微生物组 3学时 高程
第1节 肠道微生物组在代谢疾病中的作用
第2节 肠道微生物组在神经疾病中的作用
第3节 肠道微生物组在感染疾病中的作用
第三章 土壤微生物组 3学时 叶健
第1节 土壤微生物组研究概况
第2节 土壤微生物组与元素循环的关系
第3节 土壤微生物组与作物健康的关系
第4节 土壤微生物组与生态系统的关系
第四章 植物微生物组 3学时 叶健
第1节 植物微生物组研究概况
第2节 植物微生物组与植物抗病的关系
第3节 植物微生物组与营养吸收的关系
第4节 植物微生物组与生长发育的关系
第五章 真菌组 3学时 高程
第1节 真菌组研究概况
第2节 真菌组研究进展
第六章 病毒组 3学时 叶健
第1节 病毒组研究概况
第2节 人类病毒组研究进展
第3节 植物病毒组研究进展
第4节 动物病毒组研究进展
第七章 微生物组研究方法与微生物组调控机制 3学时 叶健
第1节 研究方法：宏基因组、培养组、表型组、多组学
第2节 微生物组数据分析方法
第3节 最新研究方法

叶健，中科院特聘研究员，中国科学院微生物研究所农业微生物组学和生物技术研究室主任、国家杰出青年科学基金（2021）国家优秀青年科学基金（2015）。研究方向：病毒学与生物技术。曾或正主持中科院稳定支持基础研究青年团队项目、国家自然基金重点项目、国家重点研发生物安全项目课题、中科院战略前沿领域先导B项目、新加坡自然基金重大项目等课题。兼职包括中国生物工程学会生物资源专业委员会副主任委员、中国植物病理学会病毒专业委员会秘书长、中国微生物学会病毒学专业委员会委员、中国农业生物技术学会微生物生物技术分会理事长、中国昆虫学会媒介昆虫与病原互作专业委员会委员、北京市植物病理学会常务理事等。担任农业生物技术学报副主编、Virology/Phytopathology Research/Biological Diversity/生物技术通报等国内外主流期刊的编委，曾发表50多篇具有国际影响力的文章，被引用2800多次， H-index=30，编辑出版2部中文和4部外文学术专著。授权国际专利4项均获得授权并成功转化。高程，中国科学院微生物研究所研究员，真菌学与技术创新研究室副主任，国家优秀青年基金获得者，入选中科院引才计划B类，获得择优支持。2007年本科毕业于山东大学，2013年博士毕业于中国科学院大学，2016-2020年在加州大学伯克利分校从事博士后研究，主要从事真菌组与生态功能研究，包括微生物组解构与重构；微生物组环境适应和抗逆促生； 宿主-微生物组互作与匹配。代表性成果发表在Nat Commun（3篇）, PNAS, ISME J, New Phytol（3篇）, Mol Ecol（2 篇）等，总引用2200余次，H指数23，应邀在2022年第11届国际菌根大会做主旨报告，担任mSystems、生物多样性等杂志编委。