高级微生物生态学

课程编码：180084071300P1004H 英文名称：Advanced Microbial Ecology 课时：40 学分：2.00 课程属性：学科核心课 主讲教师：葛源等

本课程是为生态学和地学相关专业研究生设置的专业核心课，适用于生态学、地学、环境科学等相关专业的学生。本课程在微生物学和生态学理论的基础上，着重介绍微生物生态学概论、微生物群落生态学基础、微生物群落时空演变特征、微生物互作、微生物多样性-功能关系、微生物组学技术等内容，结合R语言等引导学生完成微生物高通量测序数据的上机分析操作，提升学生从事微生物生态学研究的能力。

生态学、微生物学、概率与数理统计

第一章 绪论 2学时 葛源
第1节 微生物生态学概述
第2节 微生物生态学的形成和发展历史
第二章 微生物群落生态学基础 4学时 葛源
第1节 微生物群落概述：基本概念、群落特征
第2节 微生物群落表征方法
第3节 常用alpha多样性指数及其生态学意义
第4节 常用beta多样性分析方法、优缺点、应用场景
第三章 微生物群落时空演变特征 4学时 葛源
第1节 微生物生物地理学的发展
第2节 基本时空演变格局
第3节 机理解释与理论进展
第四章 微生物互作 4学时 葛源
第1节 微生物互作：互作网络、群落构建
第2节 植物-微生物互作
第3节 动物-微生物互作
第五章 微生物多样性-功能关系 4学时 葛源
第1节 微生物多样性-功能关系概述
第2节 微生物多样性控制实验
第3节 微生物群落多功能性表征
第六章 微生物组学技术基础 4学时 郭雪
第1节 微生物组学技术概述
第2节 高通量测序检测技术
第3节 宏基因组检测技术
第七章 测序数据综合分析实践 16学时 郭雪
第1节 高通量测序数据预处理
第2节 高通量测序数据的统计分析
第3节 微生物群落的互作网络分析
第4节 微生物群落构建机制解析
第八章 课程总结与考试 2学时 葛源
第1节 课程总结与考试

葛源，中国科学院生态环境研究中心研究员，中国科学院大学岗位教授，博士生导师。中国科学院“引进海外杰出人才”、“特聘骨干岗位”入选者。担任我国土壤学会土壤生物和生化专业委员会委员、生态学会微生物生态专业委员会委员、土壤学会土壤分析技术工作委员会委员，担任SCI期刊Journal of Soils and Sediments编委、栏目编辑。长期从事微生物生态学和土壤生物学研究和教学工作，担任《土壤生物学前沿》课程首席教授，研究成果发表于PNAS、ISME Journal、Environmental Science & Technology等SCI期刊。

郭雪，中国科学院生态环境研究中心研究员，博士生导师，中国科学院百人计划青年人才。现担任中国植物营养与肥料学会养分循环专业委员会委员、Frontiers in Microbiology等期刊编委，曾荣获中国新锐科技人物奖、美国生态学会亚洲分会青年生态学家奖、中国土壤学会优秀青年学者奖等荣誉。长期从事土壤微生物生态与气候变化相关研究，研究成果发表于Nature Climate Change, Nature Ecology &Evolution, Nature Microbiology, Global Change Biology等SCI期刊。