R语言在生态与进化中的应用

课程编码：1800850710Z2M3001H 英文名称：Ecology and Evoluton Using R 课时：50 学分：2.50 课程属性：专业课 主讲教师：肖治术等

本课程讲授R语言的编程技巧。教学内容以统计学的基本概念和基本分析方法为核心，通过大量实例讲解统计思想，并提供R语言的代码方便同学自己进行统计分析。没有统计学基础的同学，可以理解大约90%的课堂讲授内容，掌握统计学的基本框架，借助课件完成统计分析。有一定统计学基础的同学（学习过概率分布、假设检验、相关与回归、方差分析等）将是获益最多的群体。这些同学可以通过学习较深地理解统计学原理，并熟练地应用统计软件。课前不需要预习；课堂上要认真听讲，对不明白的问题及时反馈（在课堂上和课间提问）；课后认真复习课堂内容（每次课后至少花一小时，否则很容易遗忘）；课堂上会强调关键词和关键问题，推荐同学自己查询资料解决疑难问题。通过本课程的学习，要求学生较好地掌握生物统计学的原理和应用方法，以及统计软件R的基本分析方法，并培养出一定的自学能力。本课程内容偏多，讲课内容重复较少，课后复习至关重要！

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第一章 第一章 R语言介绍和描述统计学 3学时 李欣海
第1节 R语言介绍
第2节 描述统计学
第3节 对随机性的认识（课程思政，竖立科学的人生观）
第二章 第二章 概率论和常见的分布 3学时 李欣海
第1节 概率论
第2节 12个常见的分布
第三章 第三章 假设检验1 3学时 李欣海
第1节 原理
第2节 标准步骤
第3节 Z检验与t检验
第4节 对百分率的检验
第四章 第三章 假设检验2 3学时 李欣海
第1节 卡方检验
第2节 统计功效
第3节 假设检验的哲学基础
第4节 对假设检验的批判
第五章 第四章 方差分析1 3学时 李欣海
第1节 单因素
第2节 随机区组
第3节 双因素
第六章 第四章 方差分析2 3学时 李欣海
第1节 三因素
第2节 拉丁方
第3节 嵌套实验设计
第4节 裂区实验设计
第5节 重复实验设计
第6节 混合效应模型
第七章 第五章 相关和回归 3学时 李欣海
第1节 简单线性回归的原理
第2节 最小二乘法
第3节 模型检验
第4节 相关分析
第八章 第六章 协方差分析 3学时 李欣海
第1节 协方差分析的原理
第2节 模型参数的意义
第3节 协方差混合效应模型
第九章 第七章 数据转换和非参数统计 3学时 李欣海
第1节 数据转换
第2节 符号检验
第3节 符号秩检验
第4节 秩和检验
第5节 Kruskal-Wallis检验
第6节 Friedman检验
第7节 Bootstraping自举取样
第8节 非参数回归
第十章 第八章 多元回归和相关1 3学时 李欣海
第1节 参数估计
第2节 模型检验
第3节 多项式回归
第4节 多元相关
第十一章 第八章 多元回归和相关2 3学时 李欣海
第1节 变量的重要性
第2节 分数指数交互作用模型
第十二章 第九章 实验设计及案例分析 3学时 肖治术
第1节 实验设计
第2节 典型案例分析
第十三章 第十章 动植物互作及生态网络案例分析 3学时 肖治术
第1节 动植物互作案例分析
第2节 生态网络案例分析
第十四章 第十一章 野生动物种群估计案例分析 3学时 肖治术
第1节 种群调查新技术及标记重捕模型
第2节 占域模型及案例分析
第十五章 课程实验设计实践 3学时 肖治术
第1节 课程实验设计实践
第十六章 课程实验设计实践 3学时 肖治术
第1节 课程实验设计实践
第十七章 课程闭卷考试 2学时 肖治术
第1节 课程闭卷考试

肖治术（中国科学院动物研究所）李欣海（中国科学院动物研究所）