植物系统发育与生物地理学
课程编码：180085071001M2001H
英文名称：Plant Phylogeny and Biogeography
课时：60
学分：3.00
课程属性：专业核心课
主讲教师：汪小全等
教学目的要求
通过本课程学习，了解：1）植物的进化历史和各大类群间的进化关系；2）植物地理分布格局形成及其对全球变化的响应；3）生命之树重建的原理、方法和进展；4）生物类群间分化时间的分子钟度量；5）分子生物地理学研究方法和产地溯源技术；6）生物多样性保护的意义及其方法。本课程为研究生创建一个从大学知识学习到研究所实际研究之间过渡的平台，希望研究生从被动听课转到主动学习，参与课堂讨论，达到教学相长目的。
预修课程
植物学、遗传学、自然地理
大纲内容
第一章 植物系统发育与生物地理学简介
第1节 系统发育与生物地理学研究概论 2学时 汪小全
第2节 系统发育与生物地理学研究和绿色发展 1学时 汪小全
第二章 植物进化的化石证据
第1节 化石植物的研究基础 6学时 王宇飞
第2节 化石植物研究与系统发育重建 3学时 王宇飞
第3节 化石植物研究与古植被和古气候重建 3学时 王宇飞
第4节 研究案例分析与讨论 3学时 王宇飞
第三章 植物生命之树及其重建
第1节 生命之树重建的原理和方法 12学时 王伟
第2节 类群间分化时间的分子钟度量 6学时 王伟
第3节 陆地植物系统发育研究进展 3学时 王伟
第4节 植物生命之树重建的现状与展望 3学时 王伟
第四章 历史生物地理学
第1节 研究方法与主要假说 3学时 汪小全
第2节 分子生物地理学研究进展 3学时 汪小全
第3节 谱系生物地理学 3学时 汪小全
第4节 谱系基因组学与产地溯源 3学时 汪小全
第五章 植物系统发育与生物地理学综合研究
第1节 植物系统发育与生物地理学综合研究 3学时 汪小全
第六章 闭卷考试
第1节 闭卷考试 3学时 汪小全
参考书
1、
Tree Thinking: An Introduction to Phylogenetic Biology
Baum DA, Smith SD.
2012年
Roberts and Co.
2、
Phylogenetic Trees Made Easy: A How-To Manual, 5th Edition.
Hall BG.
2017年
Sinauer Assoc.
3、
Biogeography: Biological Diversity Across Space and Time.
Lomolino MV, Riddle BR, Whittaker RJ.
2017年
Sinauer Assoc.
4、
Phylogenetic Comparative Methods: A User's Guide for Paleontologists.
Soul LC, Wright, DF.
2021年
Cambridge University Press
5、
Paleobotany: The Biology and Evolution of Fossil Plants, 2nd Edition
Taylor TN, Taylor EL, Krings M.
2019年
Academic Press
课程教师信息
汪小全，中国科学院植物研究所研究员、博士生导师、所长，国家植物园副理事长、中国植物学会副理事长兼秘书长，中华人民共和国濒危物种科学委员会委员，国家植物标本资源库负责人，中国科学院植物科学数据中心主任，Molecular Phylogenetics and Evolution副主编、Plant Biology editor、Journal of Systematics and Evolution编委、European Journal of Taxonomy咨询编委等。主要从事植物进化生物学、生物地理学和分子生态学研究，主持国家重点研发计划项目、中国科学院战略性先导科技专项项目等。近年来在裸子植物的进化和生物地理学、青藏高原植物进化和谱系生物地理学、杜鹃花属的时空进化等研究方面取得了重要成果。迄今发表论文100余篇，其中40余篇(第一或通讯作者)在PNAS、Nat. Commun、Mol Biol Evol、Proc R Soc B、Mol Ecol、Mol Phylogenet Evol、J. Biogeogr等国际主流杂志上。1997年获中国科学院院长奖学金特别奖，1999年获首届全国优秀博士论文奖，2004年获国家杰出青年科学基金，2006年被评为中国科学院研究生院优秀教师，2009年入选“新世纪百千万人才工程”国家级人选，2011年获政府特殊津贴。已培养博士20余名，其中多位获中国科学院院长奖优秀奖等。
王宇飞，中国科学院植物研究所研究员、博士生导师，北京植物学会副理事长，Journal of Systematics and Evolution编委。主要从事植物演化生物学研究，支持国家自然科学基金重大项目之课题、国家重大科学研究计划之课题、国家自然科学基金面上项目等。近年来在新生代植物演化和古气候重建方面取得了重要成果。迄今在Earth-Sci Rev、Global Change Biol、Innovation、Quat Sci Rev等期刊发表SCI论文50余篇；获2004年度北京市科学技术二等奖（排名第二位）。
王伟，中国科学院植物研究所研究员、博士生导师，中国地理学会生物地理学专业委员会委员，国家自然科学基金和教育部学位中心通讯评审专家，《生物多样性》、《热带亚热带植物学报》、Frontiers in Plant Science等期刊编委。主要从事植物系统学和生物地理学研究，主持国家自然科学基金之青年基金、面上基金（5项），国际(地区)合作与交流项目，中国科学院战略性科技先导专项（B 类）之课题，国家重大科学研究计划子课题等。近年来在毛茛目的系统发育、分类和时空演化，亚热带常绿阔叶林的起源等研究方面取得了重要成果。迄今以第一或通讯作者在PNAS、Nat Commun、Cladistics、New Phytol、Proc R Soc B、JIPB、J Biogeogr、Mol Phylogenet Evol、Ann Bot和Taxon等国际主流杂志发表论文50余篇。2014年入选中国科学院青年创新促进会，2022年获“中国科学院朱李月华优秀教师”奖，2023年获第四届吴征镒植物学奖青年创新奖。