计算机辅助药物设计
课程编码:180082070303P3010H
英文名称:Computer Aided Drug Design
课时:40
学分:2.00
课程属性:专业课
主讲教师:崔巍
教学目的要求
本课程针对药物化学、有机化学以及化学生物学等专业的学生开设,课程内容以分子模拟和化学计量学的原理为基础,介绍合理药物设计所应用到的设计理念和方法、开源及商业的软件资源和数据库资源,并介绍这些上述软件和数据在合理药物设计过程中的实际使用方法和技巧。通过本课程的理论学习,结合上机操作,培养学生实际操作的能力,使学生初步掌握合理药物设计常用的分子对接、虚拟筛选、分子动力学模拟、定量构效关系、统计学习等方法,具备操作相关软件的能力,为今后的科学研究打好基础,同时建立计算机辅助药物设计方法的感性认识,为进一步学习分子模拟和计算化学的理论提供必要的知识储备。
预修课程
物理化学、药物化学、理论与计算化学
大纲内容
第一章 绪论 2.0学时 崔巍
第1节 绪论
第二章 分子的表示 6.0学时 崔巍
第1节 分子的表示
第三章 受体配体相互作用原理 4.0学时 崔巍
第1节 受体配体相互作用原理
第四章 受体配体相互作用的评价方法(I)分子对接和虚拟筛选 6.0学时 崔巍
第1节 受体配体相互作用的评价方法(I)分子对接和虚拟筛选
第五章 受体配体相互作用的评价方法(II)分子动力学和自由能计算 6.0学时 崔巍
第1节 受体配体相互作用的评价方法(II)分子动力学和自由能计算
第六章 受体配体相互作用的评价方法(III)定量构效关系方法和统计学习 6.0学时 崔巍
第1节 受体配体相互作用的评价方法(III)定量构效关系方法和统计学习
第七章 新化学实体的设计 4.0学时 崔巍
第1节 新化学实体的设计
第八章 其他计算机辅助药物设计方法 4.0学时 崔巍
第1节 其他计算机辅助药物设计方法
教材信息
1、
计算机辅助药物分子设计
徐筱杰
2004年1月
化学工业出版社
参考书
1、
药物分子设计
Gisbert Schneider
2012年3月
科学出版社
2、
常用计算机辅助药物设计软件教程
张亮仁
2017年4月
中国医药科技出版社
课程教师信息
主讲教师 崔巍副教授