微生物组与微生物基因组学

课程编码：180200100103P3004H 英文名称：Microbiome and Microbial Genome 课时：50 学分：2.50 课程属性：专业课 主讲教师：朱宝利等

本课程是重点介绍微生物组学的学科演化，以及生物信息学、人类基因组学和病原基因组学学科的形成。同时，课程就基因组学前沿技术、生物信息在微生物组学研究中作用，以及微生物基因组学技术在突发新发传染性疾病病原检测监测中的应用研究进行较为全面的讲解。通过本课程教学，使学生能够全面了解微生物组学及相关的生物信息学、人类基因组学和病原基因组学的形成和相互关系，熟悉微生物组学技术的特性，以及这些技术在病原微生物临床检测和监测中的应用。

微生物学和分子生物学

第一章 人类基因组计划与微生物组 12学时 朱宝利
第1节 人类基因组计划与微生物基因组学
第2节 人体微生物组特征及分析
第3节 人体微生物组与药物互作对人类健康和疾病的影响
第4节 环境微生物组学
第二章 基因组测序技术与人体微生物组分析 15学时 朱宝利
第1节 Sanger一代测序技术
第2节 454及Illumina二代测序技术
第3节 PacBio 三代单分子实时测序技术
第4节 NanoPore四代纳米孔测序技术
第5节 16S rRNA基因测序
第6节 元基因组学及其应用
第三章 单细胞测序技术 12学时 杜文斌
第1节 单细胞基因组学
第2节 单细胞转录组学
第3节 单细胞操控新技术
第4节 单细胞多组学联用技术
第5节 单细胞组学技术的发展现状和应用
第四章 临床病原分子诊断技术与应用 9学时 杜文斌
第1节 病原微生物诊断技术概述
第2节 基于核酸扩增子的病原诊断技术
第3节 分子诊断与POCT病原检测技术
第4节 宏基因组测序技术的临床病原诊断应用

朱宝利，中科院微生物所研究员，博士生导师，973首席科学家。1992年毕业于北京农业大学，获理学博士学位。主要从事病原微生物比较基因组学、肠道微生物元基因组学、人类疾病与免疫基因组学等方面的研究；同时，还进行临床分子检测技术的及DNA 检测芯片的研究与开发。

杜文斌 中科院微生物所研究员，2007年在浙江大学获得博士学位，研究内容主要是利用新的分析化学和微流控技术手段来提高微生物学研究的时空分辨率。