生态基因组学
课程编码：1800850710Z1P2001H
英文名称：Ecological Genomics
课时：60
学分：3.00
课程属性：专业核心课
主讲教师：康乐等
教学目的要求
生态基因组学是一门交叉科学，是生态学和基因组学的完美融合。它的原理和方法吸取了来自环境科学、进化生物学、入侵生物学、种群遗传学、环境微生物学、分子生物学、细胞生物学的精华。生态基因组学的总体目标是将基因型和表现型联系起来，找到最终适应环境的机制。通过本课程的讲授，目的是提高学生对生态基因组学的认识，深入了解生态基因组学的基本概念、研究内容、重要研究进展和该领域的新方法、新理论。要求学生在学习的基础上，对物种形成、表型可塑性、生物对环境胁迫和全球变化响应及其分子、遗传和表观遗传学机制有一个全面的了解。
预修课程
无
大纲内容
第一章 基因组学概论 6学时 康乐
第1节 基因组学
第2节 非编码序列、非编码基因和非编码RNA
第二章 生态基因组学概论 6学时 康乐
第1节 生态基因组学：当生态学遇到基因组学
第2节 生物群体与环境的互作
第三章 态基因组学研究中的生物信息学方法 9学时 赵方庆
第1节 高通量测序技术的原理和应用
第2节 测序数据的质控和遗传变异的识别
第3节 转录组测序分析的原理及应用
第四章 水生生态系统环境胁迫的群落生态学效应 9学时 战爱斌
第1节 水生生态系统遭受的环境胁迫
第2节 利用宏基因组学研究环境胁迫的群落生态学效应
第3节 I型错误和II型错误
第五章 微生物群落研究中的生态基因组学 9学时 朱宝利
第1节 人类基因组计划与人体微生物组研究
第2节 肠道微生物组学与健康研究进展
第3节 微生物基因组测序与分析技术
第六章 生态表观基因组学 15学时 王宪辉
第1节 表观遗传学与生态适应
第2节 非生物环境胁迫适应的表观遗传机制
第3节 表型可塑性的表观遗传调控机制
第4节 生物间互作的表观遗传调控机制研究
第5节 快速生态适应的表观遗传学机制
第七章 实践课
第1节 实践课 3学时 康乐
第八章 考试
第1节 考试 3学时 康乐
参考书
课程教师信息
康乐研究员（院士）（中国科学院动物研究所）赵方庆研究员（中国科学院生命科学研究所）战爱斌研究员（中国科学院生态环境研究中心）朱宝利研究员（中国科学院微生物研究所）王宪辉研究员（中国科学院动物研究所）