课程大纲

课程大纲

生命组学

课程编码:1800850710Z1M2001H 英文名称:Life-omics 课时:60 学分:3.00 课程属性:专业核心课 主讲教师:于军等

教学目的要求
教学内容包括:以基因组学、表观组学、RNA组学、蛋白质组学、代谢组学等为代表的生命科学前沿发展日新月异,生命组学将介绍这些领域的基本概念、常用技术与发展方向。“组学”的基本属性是高通量获取数据、构建并行化技术平台和完善规模化、系统化的科学研究体系。生命组学基本研究内容包括如下几个领域:(1)生物医学(生理解剖板块);(2)分子与细胞生物学(分子细胞板块);(3)遗传与群体遗传学(基因型表型板块);(4)多流系统生物学(现象机制板块)。
教学目的包括:(1)在“五流通悟”(信息流、操作流、平衡流、分室流和可溯流)的思维框架下,介绍生命组学各领域的基本概念、基本方法和基本科学问题。(2)深入介绍生命组学核心领域的主要技术和原理;(3)回顾生命组学各领域的发展,总结近五年来的进展,展望未来的可能应用和发展前景。

预修课程

大纲内容
第一章 前言:从“人类基因组计划”到全民基因组测序工程
第1节 《人类基因组计划》与全民基因组测序的应用 1学时 于军
第2节 数字基因、数字医疗与数字健康 2学时 于军
第3节 “三数工程”、元宇宙、健康中国2030 1学时 于军
第二章 基因组学技术
第1节 DNA测序技术 4学时 于军
第2节 数据库与生物信息技术 10学时 章张
第三章 谱系基因组学入门
第1节 宏/泛基因组 8学时 肖景发
第2节 脊椎动物和人类基因组研究 4学时 肖景发
第四章 生命组学入门
第1节 生命科学新范式与组学概论 4学时 于军
第2节 表观遗传学的基本概念与技术 2学时 肖景发
第3节 精准医学相关数据库 4学时 肖景发
第4节 RNA组学的基本概念与单细胞转录组技术 2学时 肖景发
第五章 蛋白质组学概论
第1节 蛋白质组学概论 6学时 肖景发
第六章 代谢组学与其他组学应用
第1节 代谢组学与其他组学应用 4学时 于军
第七章 课堂讨论
第1节 首席教授课堂讨论 2学时 于军
第2节 主讲教师1课堂讨论 2学时 肖景发
第3节 主讲教师2课堂讨论 2学时 章张
第八章 考试
第1节 考试 2学时 于军

参考书
1、 遗传遗传学:从基因到基因组 于军 2020年 科学出版社
2、 基因组学与精准医学 于军 2017年 上海交通大学出版社
3、 基因组科学的甲子“羽化”之路: 从人类基因组测序到精准医学 于军 2016年 科学出版社
4、 第二代测序信息处理 吴佳妍,肖景发 2014年 科学出版社
5、 蛋白质组学研究-概念、技术及应用 张丽华 2010年 科学出版社

课程教师信息
于军,中国科学院北京基因组研究所,生物信息学
肖景发,中国科学院北京基因组研究所,生物信息学
章张,中国科学院北京基因组研究所,生物信息学