实用生物信息学（1）:高通量测序数据分析技术

课程编码：100100M02012H 英文名称：Practical Bioinformatics (1): Data Analysis for High Throughput Sequencing 课时：50 学分：3.00 课程属性：一级学科普及课 主讲教师：赵方庆等

本课程以新一代测序技术的应用与数据分析、基因组、转录组为主题，设计具有前沿性、实用性和针对性强的理论课程和上机实操课程，旨在使学生掌握高通量测序数据分析的关键技术，了解基因组学和生物信息学领域的研究进展和技术手段，为生物医学及相关专业学生进一步学习与此相关课程打下基础。

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第一章 高通量测序技术基础与基因组分析技术及实践
第1节 高通量测序技术与生物医学前沿 3.0学时 赵方庆
第2节 Linux编程基础及上机实践 6.0学时 赵方庆
第3节 高通量测序技术原理及应用 6.0学时 苗苗
第4节 基因组结构变异的识别与注释 3.0学时 赵方庆
第5节 基因组拼接及基因识别 6.0学时 赵方庆
第6节 系统发育基因组分析技术 6.0学时 苗苗
第二章 转录组分析技术及实践
第1节 测序数据的预处理及重测序数据中遗传变异的识别 6.0学时 何顺民
第2节 mRNA转录组分析技术及实践 3.0学时 何顺民
第3节 microRNA 转录组分析技术及实践 3.0学时 何顺民
第4节 lncRNA转录组分析技术及实践 3.0学时 何顺民
第5节 circRNA转录组分析技术及实践 3.0学时 赵方庆
第三章 高通量测序技术前沿 2学时 苗苗
第1节 文献精读与讨论

授课人：
赵方庆 研究员（中国科学院北京生命科学院）
何顺民研究员（中国科学院生物物理研究所）
苗 苗 教授（中国科学院大学医学院）

助 教：
史文聿 助理研究员（中国科学院微生物研究所）