药物设计方法学

课程编码：100700M01001H 英文名称：Methodology of Drug Design 课时：50 学分：3.50 课程属性：一级学科核心课 主讲教师：李学兵等

药物设计方法学旨在学习药物从发现到上市的过程，以及新药研究开发的基本思路和方法、着重学习先导化合物的发现、先导化合物的优化、临床前新药研究的主要内容和方法、前药的设计与应用、构效关系、计算机辅助药物设计等方法, 使学生了解、熟悉、掌握药物研究的基本思路和基本概念，为进一步从事药物设计与开发奠定基础。

生物化学、有机化学、药物化学

第一章 药物设计的生命科学基础 3学时 李学兵
第1节 药物作用的靶点
第2节 药物与生物大分子靶点的相互作用
第3节 生物膜与药物跨膜转运
第二章 基于细胞间信号转导的药物设计 3学时 李学兵
第1节 细胞间的信号转导
第2节 基于调节第二、三信使的药物设计
第3节 基于基因调控机制的药物设计
第三章 基于内源性活性肽的药物设计 3学时 张亮仁
第1节 肽类化合物的结构特征，类肽的设计原理与方法
第2节 构型限制性氨基酸的设计，肽链骨架的修饰和肽二级结构的模拟
第3节 脑啡肽类似物和肾素抑制剂
第四章 以酶为靶点的药物设计 3学时 张亮仁
第1节 酶的分类，酶促动力学特征和激活与抑制
第2节 酶抑制剂的设计原理、发展与分类
第3节 ACE，HIV逆转录酶，COX-2，神经氨酸酶抑制剂
第五章 基于核酸原理的药物设计 3学时 李学兵
第1节 核酸的结构及其生物合成
第2节 代谢拮抗类抗肿瘤、抗病毒药物设计
第3节 核苷类抗病毒药物的设计和反义核酸
第六章 基于药物代谢原理的药物设计 3学时 李学兵
第1节 前药概念，前药原理，前药设计的目的与方法
第2节 软药的概念及其应用
第3节 孪药的基本概念、分类及其应用
第4节 靶向抗癌前药的设计
第七章 基于生物电子等排原理的药物设计 3学时 李中军
第1节 生物电子等排体，Grimm氢化物取代规则，经典与非经典生物电子等排体分类
第2节 经典生物电子等排体取代
第3节 非经典生物电子等排体类型，Me Too药物概念，优点及设计策略
第八章 基于分子杂合原理的药物设计 3学时 李学兵
第1节 分子杂合原理
第2节 栾药的分类及应用
第3节 多靶点药物的设计及在各类疾病中的应用
第九章 基于组合化学库的药物设计 3学时 李中军
第1节 组合化学基本概念与一般合成方法
第2节 组合化学库的种类及构建
第3节 组合化学库的高通量筛选技术
第十章 基于化学基因组学的药物设计 3学时 李中军
第1节 化学信息学基本概念，化学数据分析与化学数据库构建
第2节 生物信息学的研究目标及任务
第3节 化学基因组学与药物设计
第十一章 基于靶点的药物设计 3学时 张亮仁
第1节 靶蛋白结构的预测
第2节 虚拟筛选技术
第3节 全新药物设计
第4节 基于片段的药物分子设计
第十二章 基于配体结构的药物设计 3学时 张亮仁
第1节 定量构效关系
第2节 药效团模拟及其应用
第十三章 类药性及其在药物设计中的应用 3学时 李中军
第1节 类药性及其评价方法和应用
第2节 基于类药性的药物设计策略
第十四章 新药开发的基本途径与方法 3学时 李中军
第1节 人类功能基因组学、重大疾病相关基因的发现与表达
第2节 先导化合物发现的基本途径及其结构优化
第3节 临床前药物体内外药效学评价，临床前安全评价，药物临床研究
第十五章 计算机辅助药物设计上机操作 3学时 张亮仁
第1节 计算机虚拟筛选技术
第2节 分子对接技术
第3节 3D-QSAR法
第十六章 药物设计实例分析 3学时 李学兵
第1节 选择代表性药物介绍新药的开发方法与研发过程

李学兵，课程首席教授，中科院微生物所研究员，国家重点研发计划项目首席科学家。主要以病毒、细菌致病过程中的重要蛋白为靶点，设计研发新型抗感染药物，发表SCI文章20余篇。
李中军，课程主讲教师，北京大学药学院化学生物学系教授，主任，北京大学最受学生欢迎 “十佳教师”。主要从事糖化学生物学及创新药物研究。已发表SCI文章100余篇。
张亮仁，课程主讲教师，北京大学药学院教授，曾任北京大学药学院副院长、药物化学系主任。主要从事以结构为基础的药物设计与合成。